Rumah Santri adalah program husus pondok pesantren AL-BAHA. Dalam program ini dibatasi hanya 15-20 santri yang langsung dibimbing oleh 1 orang murobbi dengan bimbingan selama 24 jam. Santri dan murobbi tinggal dalam 1 kamar bersama.
Santri difokuskan untuk menghafal Al-Qur'an (tahfidz) dan belajar membaca kitab-kitab kuning.